Несмотря на то, что ни крещение, ни причастие не являются обязательными для спасения, мы утверждаем, что эти таинства являются существенными с библейской и богословской точек зрения. Ведь Сам Господь Иисус повелел Церкви совершать установленные Им таинства. Это ясная заповедь, данная Господом Иисусом Христом Своей Церкви (см. Ев. от Матфея 28:19–20). Однако время крещения (крещение младенцев или крещение после покаяния), способ крещения (окропление или погружение), впрочем, как и суть и смысл причастия мы относим к той категории, из-за которой не будем разделять Христианского общения, как внутри церквей, так и внутри ассоциации.
В Свободных Евангельских церквях в вопросах как убеждений, так и практики преобладает крещение верующих через погружение. Некоторые церкви могут практиковать крещение младенцев, хотя не рассматривают его как необходимое для спасения. Мы призываем наши поместные церкви выбрать один подход к крещению и придерживаться его, чтобы не смущать своих прихожан и членов ненужными спорами.
Однако, мы также понимаем, что в наших исторических и культурных условиях мы часто сталкиваемся с крещением во младенчестве, которое не отражало веры родителей, а служило неким «оберегом». Поэтому мы принимаем в члены церкви и допускаем к причастию лишь тех, кто либо принял крещение во имя Отца, и Сына, и Святого Духа после обращения к Богу в молитве покаяния, либо тех, кто, приняв крещение во младенчестве, затем подтвердил его, пройдя катехизацию, конфирмацию или воцерковление в той общине, в которой вырос. Мы с уважением относимся к этому духовному опыту человека и к тем Христианским традициям, в которых они выросли. Но для нас важно, чтобы крещение во младенчестве затем было подтверждено во взрослом возрасте.
В вопросе причастия в Свободных Евангельских церквях есть общины, придерживающиеся как понимания, что в хлебе и вине есть реальное присутствие (лютеранский взгляд), так и те, кто верит в духовное присутствие (реформатский взгляд), так и те, кто воспринимают хлеб и чашу исключительно, как символы крови и тела Христа. Это означает, что внутри одних церквей в нашей ассоциации причастие могут совершать лишь рукоположенные служители в то время, как в других церквях могут быть правила, допускающие принятие членами или прихожанами церквей причастия дома в том случае, если они не могут физически присутствовать в церкви. Мы сохраняем евхаристическое общение со всеми общинами и верующими вне зависимости от их позиции.
Мы считаем, что в таинстве святого причастия обязательно должен использоваться хлеб и вино так, как заповедал нам это Сам Господь в ночь, когда Он был предан. При этом мы не спорим о том, каким именно должен быть хлеб (пресным или нет) или о том, насколько забродившим должен быть виноградный сок, чтобы считаться вином. Мы допускаем в наших церквях использование виноградного сока или вина на причастии.